南京航空航天大学秦淮创新研究院是2018年2月由南京航空航天大学与秦淮区人民政府签约共建，2018年5月完成了作为独立法人的研究院注册，2018年11月入驻白下高新园区三才大厦。

南航秦淮研究院将以“航空特色、智造优势、多元开放、产研融合”为基本原则，以高端装备、智能制造和动力系统的科技成果转化为主线，聚焦核心技术突破、高端产业培育、信息技术与工业制造融合发展，涵盖航空、航天、汽车、交通、能源等工业领域，通过政策激励和机制创新，把创新研究院建成高端产业技术研发基地、高端人才集聚发展高地、高新技术企业孵化基地和重大科技成果转化基地，为秦淮区经济社会发展提供人才、科技和产业支撑，为南京创新名城建设提供强大助力。

研究院依托南京航空航天大学的科研、学科及人才优势，重点围绕高端装备制造、智能制造和高端产业动力系统需求，在动力系统、电气系统、智能汽车、新能源汽车等领域，已成立新型研发机构一个(南京天航智能装备研究院有限公司）、三个研发中心（航空智能电气系统研发中心、航空机载设备研发中心、智能与新能源汽车研发中心）。

研究院（含引进和孵化企业）现有员工148人，全日制硕士以上学历50人，博士学位或高级职称的高端人才28人。2人入选“国家万人计划”，1人入选“南京市科技顶尖专家”（院士等A类人才），1人入选“南京市创新型企业家”，1人入选“2019年度南京市中青年拔尖人才培养对象”，1人入选“2019年度秦淮区中青年优秀人才”，3人入选“江苏省技术经理人”。已申请发明专利28件（包含PCT专利13件），获得集成电路布图专利3件、实用新型专利12件、软件著作权51件、外观设计专利2件。

自入驻以来，研究院累计引进和孵化企业20家。其中南京天航智能装备研究院有限公司已入选“南京市新型研发机构”、“南京市高企培育库”、“江苏省科技中小型企业培育库”，并在2019年度新型研发机构绩效评估中，获得优秀奖及市级绩效奖励。在引进孵化企业中，1家企业获得“江苏省研究生工作站”；3家企业入选“江苏省科技中小型企业培育库”等；1家企业通过软件产品认证，并获得 “江苏省软件企业”资质；4家企业参加创业南京项目，其中3家企业入选秦淮区创业南京计划，并分别获得政府扶持资金50万元资助。